신칸센에 숨은 인질 협박범

도쿄로 향하는 신칸센에서 줄을 서는 핫토리 헤이지와 토야마 카즈하와 오오카 모미지. 카즈하와 헤이지는 란과 만나기 위해 승차하고, 모미지는 도쿄에 백인일수의 시합이 있기 때문에 탄다고 한다. 실은 헤이지가 도쿄로 향한다는 정보를 입수한 집사 이오리 무가가, 헤이지의 옆자리를 확보해 우연을 가장해 모미지를 앉힌 것이다. 이오리는 3명의 앞자리에 앉아 있었지만, 술취한 남자가 맥주를 뿌려 세면대에 옷을 씻으러 간다. 어째서인지 세면대에 스마트폰이 놓여 있고 전화를 이오리가 받으니, 스마트폰의 목소리의 주인은 「전 공안의 이오리」라고 하는 정체를 알고 있었다. 그리고 명령을 따르지 않으면 모미지를 덮치겠다고 위협받는다. 명령은 차내에서 죽어 있는 중년 남자로부터 USB 메모리를 회수하는 것. 죽은 남자는 프리라이터로, 정치가의 수뢰의 증거를 USB 메모리에 기록하고 있었던 것. 이오리가 남자의 수하물을 확인하고 있을 때 이오리가 늦는 것을 걱정한 헤이지가 찾아오지만, 곧 떠난다. 그리고 수하물을 조사하면서 이오리는 3년전의 공안경찰관 시절의 일을 떠올리고 있었다. 이오리에게 다시 온 헤이지는, 이번에는 스마트폰을 보여주면서 음료를 권한다. 하지만 스마트폰에는 코난으로부터의 메세지가 있었다. 이오리의 위기를 감지하고 있던 헤이지는 이오리를 돕기 위해 코난과 연락을 취하며 이미 움직이고 있던 것. 집사와 탐정은 협력하여 범인들을 특정하고 난국을 헤쳐나갈 수 있을까?!