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1. 개요
나루토의 줄거리를 정리한 문서. 보다 자세한 스토리를 알고 싶다면, 이 만화의 더블 주인공이라 할 수 있는 우즈마키 나루토와 우치하 사스케 문서의 작중 행적을 참고할 것.원작 에피소드만 작성. 애니메이션 오리지널 에피소드는 나루토(애니메이션) 참고.
2. 1부
2.1. 프롤로그 & 파도 나라 편
2.2. 중급 닌자 시험 편
2.3. 츠나데 수색 편
2.4. 사스케 탈환 편
3. 2부
3.1. 카제카게 구출 편
3.2. 사스케 수색 편
단행본 32~35권야마토, 사이와 새롭게 7반을 구성하고 사스케를 찾으러 가는 에피소드. 여기서 오로치마루와 싸울 때 나루토의 구미 폭주 장면이 나온다.
3.3. 제 10반 편
단행본 35~38권본격적으로 아카츠키의 정체가 드러나는 편. 아스마가 히단 카쿠즈 콤비에게 죽임을 당하자 10반과 카카시가 원수를 갚기 위해 싸우는 에피소드. 여기서 시카마루가 주인공급으로 활약한다.
3.4. 이타치 추적 편
단행본 38~43권사스케가 주인공급으로 나오는 에피소드. 오로치마루를 봉인해버리고 그의 실험체들과 뱀팀을 구성한 사스케는 이타치를 지속적으로 추적하고, 도중에 아카츠키의 데이다라를 처치한다. 결국 이타치도 쓰러뜨리지만 토비로부터 진실을 듣고 복수를 결심하게 된다
해당 편 중반에 지라이야의 비 마을 잠입 스토리도 나온다.
3.5. 페인 편
단행본 44~48권아카츠키의 리더 페인과 선인 모드를 익힌 나루토의 대결을 그린 에피소드. 자세한 내용은 페인(나루토) 항목을 참조.
의견은 갈리지만 나루토 최고의 에피소드로 전성기 중 하나라는 평가가 많다.
3.6. 닌자대전 준비 편
단행본 48~55권48~50권 까지는 오카게 회담 편이라 칭하기도 한다.