1. 운항 노선
취항 계획은 발표되었으나 아직 운항을 시작하지 않은 노선은 취소선으로 처리한다.운항중인 모든 노선에서 벨리카고 사업도 진행중이다.
| 국가 | 도시 | 공항 | 편명 | 운항횟수 |
| 정기편 | ||||
| [[일본|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 도쿄 | 나리타 국제공항 | YP731/YP732 | 5회/주[1] |
| [[태국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 방콕 | 수완나품 국제공항 | YP601/YP602 | 5회/주[2][3][변동적] |
| [[미국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 로스앤젤레스 | 로스앤젤레스 국제공항 | YP101/YP102 | 7회/주[변동적] |
| 뉴욕(뉴어크) | 뉴어크 리버티 국제공항 | YP131/YP132 | 6회/주[6][변동적] | |
| 샌프란시스코 | 샌프란시스코 국제공항 | YP111/YP112 | 4회/주[8] | |
| | | | | |
| [[베트남|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | | | | |
| [[홍콩|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | | | | |
| 부정기편 | ||||
| [[방글라데시|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 다카 | 샤잘랄 국제공항 | YP5671/YP5672 | 1회/2주[16] |
2. 향후 취항 계획
모두 인천 발착으로 운항될 노선이다.현재 목록에 있는 노선은 에어프레미아가 취항을 검토 중이라 발표한 것이다. 신규 항공기 도입 시기와 향후 예상 수요 및 운수권 문제 해결에 따라 천천히 취항할 것으로 보인다.
2018~2019년 공식 취항 전 발표 자료는 다음과 같다.
국토부 면허 발급 보도자료('19.3.5) 및 면허 신청 공고('18.11.16)에 기재된 취항 계획이다. 괄호 안은 면허 신청 시 제출한 주간 운항 횟수며, 경영권 싸움 이후 변경된 사항이다.
2025년 1월 기준 유럽 노선의 정기편에 대해 알려진 바가 없다. 에어프레미아가 유일하게 취항했던 유럽 정기편인 프랑크푸르트 노선은 취항한지 1년도 안되어 단항하기도 했으며, 또한 대한항공과 아시아나항공의 합병으로 인해 많은 유럽 노선을 티웨이항공이 가져가기도 했기 때문에 유럽 정기 노선은 아예 취항을 안 하거나 1, 2곳만 취항할 수도 있다. 다만 유럽 노선의 정기편 취항을 원하는 목소리도 있고, 여러 유럽 노선을 부정기편으로 운항한 경력이 있기에 추후에 기재 확보가 된 이후에는 유럽 정기 노선도 공략할 가능성이 있다.
항공기가 추가 도입이 되는데로 2025년 1월 이후부터 미주와 홍콩, 동남아 등의 노선에 신규 취항할 예정이다. 이 외에도 추가 도입이 완료되면 시애틀에도 2025년 하반기를 목표로 신규 취항할 예정이다.
| 국가 | 도시 | 공항 | 편명 | 운항횟수 |
| 향후 운항 노선 | ||||
| [[미국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 시애틀 | 시애틀 타코마 국제공항[17] | 미정 | 미정 |
| [[일본|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 오사카 | 간사이 국제공항 | ||
| 나고야 | 센트레아 나고야 중부국제공항 | |||
| 후쿠오카 | 후쿠오카 공항 | |||
| [[중국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 시안 | 시안 셴양 국제공항 | ||
| 선전 | 선전 바오안 국제공항 | |||
| [[베트남|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 하노이 | 노이바이 국제공항 | ||
| [[필리핀|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 마닐라 | 니노이 아키노 국제공항[18] | ||
| [[인도네시아|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 자카르타 | 수카르노 하타 국제공항 | ||
| [[태국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 푸켓 | 푸켓 국제공항 | ||
| [[캐나다|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 밴쿠버 | 밴쿠버 국제공항 | ||
| [[프랑스|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | | 미정[20] | ||
| [[이탈리아|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 로마 | 레오나르도 다 빈치 국제공항[21] | ||
| [[호주|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 미정 | 미정[22] | ||
3. 과거 운항 노선
에어프레미아가 과거에 운항했던 노선들이다. 김포~제주 구간을 제외하면 전부 인천 발착이다.- 2023년 9월 11일부터 2024년 3월 11일까지, 같은 해 3월 26일부터 6월 6일까지, 8월 20일부터 10월 31일까지의 3번을 부정기편으로 인천~바르셀로나 노선을 운항했다.
| 국가 | 도시 | 공항 | 편명 | 운항횟수 |
| 국내선 | ||||
| [[대한민국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 서울 | 김포국제공항 | YP541/YP545 | 2회/일 |
| [[대한민국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 제주 | 제주국제공항 | YP542/YP546 | |
| 국제선 | ||||
| [[싱가포르|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 싱가포르 | 싱가포르 창이 공항 | YP631/YP632 | 4회/주 |
| [[베트남|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 호찌민 | 떤선녓 국제공항 | YP651/YP652 | |
| [[독일|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 프랑크푸르트 | 프랑크푸르트 공항 | YP231/YP232 | |
| 부정기편 | ||||
| [[튀르키예|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 앙카라 | 앙카라 에센보아 공항 | YP5201/YP5202 | 1회/주[23] |
| [[노르웨이|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 오슬로 | 오슬로 공항 | YP5211/YP5212 | 1~2회/주[24] |
| [[미국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 호놀룰루 | 다니엘 K. 이노우에 국제공항 | YP5151/YP5152 | 4회/주[25] |
| [[스페인|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 바르셀로나 | 바르셀로나 엘 프라트 국제공항 | YP5245/YP5246 | 2회/주[26] |
| [[방글라데시|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 다카 | 샤잘랄 국제공항 | YP5671/YP5672 | 1회/2주[27] |
[1] 화, 목요일 제외 매일 운항[2] 월, 금요일 제외 매일 운항[3] 2025년 1월 26일부터 주 5회에서 주 6회로 증편, 2월 13일부터 주 7회로 증편 예정.[변동적] 2025년 2월은 신규 기재의 도입이 늦어지고 있어, 운항이 변동적이므로 에어프레미아의 홈페이지를 참고하는 것이 좋다.[변동적] [6] 화요일 제외 매일 운항.[변동적] [8] 월, 수, 금, 일요일[9] 2025년 6월 정기편으로 취항[10] 아래의 부정기편 운항 시절의 편명을 따서 151편, 152편으로 될 가능성이 높다.[11] 추후에 바뀔 가능성이 있으며 운항 요일은 미정이다.[12] 2025년 1월 23일 신규 취항[13] 수, 목, 토, 일 운항[14] 2025년 1월 24일 신규 취항[15] 월, 수, 금, 일요일 운항[16] 화요일에만 운항.[17] 2025년 하반기 목표.[18] 2024년 5월에 주 2,240석을 공급하는 조건으로 운수권을 취득했다.#[19] 프랑스과의 항공 협정에서 취항이 가능한 국적사는 2곳으로 제한되어 있는데, 본래 대한항공이 아시아나항공의 인수를 전제로 아시아나항공이 가지고 있는 운수권을 양도하기로 하였으나 티웨이로 노선을 틀어 티웨이항공이 파리에 취항하면서 파리 취항은 요원한 상황이다.[20] 취항한다면 파리 샤를 드골 공항이 유력했다.[21] 이곳 역시 티웨이항공이 취항하면서 에어프레미아의 취항에 어려움이 생겼다.[22] 2024년 5월에 주 1,241석 공급 조건으로 호주의 운수권을 취득했다.#[23] 첫 번째 부정기편은 토요일, 두 번째 부정기편은 목요일에 운항했었다.[24] 첫 번재 부정기편은 목요일에 고정 운항하며, 일부 기간중 월요일 추가 운항했었다. 두 번째 부정기편은 화요일에 고정 운항하며, 일부 기간 중 목요일 추가 운항했었다.[25] 월, 수, 금, 일요일에 운항했었다.[26] 첫 번째 부정기편은 월, 목요일에, 두 번째와 세 번째 부정기편은 화, 목요일에 운항을 했었다.[27] 첫 번째 부정기편은 화요일, 두 번째 부정기편은 일요일에 운항했었다.